ورود به سامانه عضویت در سامانه
 
صفحه اصلی مقالات پذیرفته شده
شیوع ویروس موزائیک گوجه فرنگی در برخی محصولات سبزی و صیفی کشور و آنالیز تبارزایی ژن پروتئین پوششی آن
کد مقاله : 1910-IPPC
نویسندگان:
آناهیتا حامدی *1، سارا یزدانی خامنه2، آذین آقازاده3، پرستو جهانشاهی4، سمانه ابوترابی5، علیرضا گلنراقی6، مژده ملکی7
1شهرک غرب-فاز1-خیابان ایران زمین-خیابان گلستان جنوبی-کوچه شهید خواجه بیگی-پلاک 21
2تهران_خیابان استاد مطهری_خیابان امیراتابک_کوچه مسجد_پلاک 26_طبقه دوم
3تهران_شهرک اکباتان_فاز 2_بلوک 14_ورودی 2_طبقه اول_واحد180
4تهرانپارس-خیابان بهار-بین خیابان 107و109-کوچه 126-پلاک100-طبقه2
5تهران-خیابان ستارخان-خیابان بهبودی-کوچه بهکیش-طبفه دوم
6عضو هیئت علمی / دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران
7عضو هیئت علمی/ دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین-پیشوا
چکیده مقاله:
ویروس موزائیک گوجه‌فرنگی (ToMV) در سراسر جهان گسترش داشته و می‌تواند بسیاری از خانواده‌های نهاندانگان را آلوده نماید. به منظور بررسی وقوع ToMV در محصولات سبزی و صیفی استان‌های خوزستان، سمنان و تهران، طی فصل‌های زراعی 92-1390 بازدیدهایی از این مناطق انجام شد. در مجموع، 1245 نمونه‌ی برگی از سبزیجات، سیب‌زمینی و علف‌های هرز با علائم شبه ویروسی موزاییک، پیسک، بدشکلی برگ، سبزردی، زردی و کم‌رشدی جمع‌آوری گردید. این نمونه‌ها به وسیله‌ی آزمون الایزا و به کمک آنتی‌بادی‌های اختصاصی ToMV (بیوربا، سوئیس) مورد سنجش قرار گرفتند. بر اساس نتایج الایزا، نرخ آلودگی ویروسی در خوزستان (%6/27) بیشتر از تهران (%9/5) و سمنان (%3/5) بود. در مجموع، آلودگی به ToMV در %6/11 از نمونه‌های بررسی شده ردیابی گردید. آلودگی به توباموویروس در نمونه‌های دارای واکنش مثبت در الایزا به‌وسیله‌ی آزمون RT-PCR و به‌کمک جفت آغازگرهای توصیف شده قبلی شامل Tob-Uni1/Tob-Uni2 و Tob-Uni1/ToMVspec تأیید شد. همچنین، توالی نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی (CPG) مربوط به 16 جدایه‌ی ToMV تعیین و با 17 جدایه‌ی دیگر ایرانی و 79 جدایه از سراسر جهان مقایسه گردید. با استفاده از برنامه‌های مختلف ردیابی نوترکیبی موجود در نرم‌افزار RDP4، هیچ ناحیه‌ی نوترکیبی در توالی‌های CPG یافت نشد. روابط تبارزایی به وسیله‌ی الگوریتم maximum likelihood و با استفاده از نرم‌افزار MEGA 6.0 بررسی گردید. نتایج نشان داد که جدایه‌های ToMV در سه دسته گروه‌بندی می‌شوند؛ دسته‌ی I شامل جدایه‌هایی از سراسر جهان و 26 جدایه‌ی ایرانی (شامل جدایه‌های مورد مطالعه در این تحقیق) بود، دسته‌ی II از یک جدایه‌ی برزیلی تشکیل شده بود، و دسته‌ی III مشتمل بر سه جدایه‌ی برزیلی، یک جدایه‌ی چینی و هفت جدایه‌ی ایرانی بود. نتایج به دست آمده، اطلاعات ما را در مورد روابط تبارزایی بین جمعیت‌های ایرانی و جهانی ToMV افزایش می‌دهد. همچنین در این مطالعه، وقوع طبیعی این ویروس روی خیار، بادنجان، سیب‌زمینی، فلفل، گوجه‌فرنگی و کدو در کشور گزارش می‌شود.
کلیدواژه ها:
سبزیجات، ویروس موزاییک گوجه‌فرنگی، ژن پروتئین پوششی، تعیین توالی، آنالیز تبارزایی
وضعیت : چکیده برای ارائه پذیرفته شده است