ورود به سامانه عضویت در سامانه
 
صفحه اصلی مقالات پذیرفته شده
تعیین توالی بخشی از ناحیه ITS-rDNA و تجزیه و تحلیل مقدماتی فیلوژنتیکی جدایه‌های کلادوسپوریوم در شمال ایران
کد مقاله : 2128-IPPC
نویسندگان:
امیررضا امیرمیجانی *1، سید اکبر خداپرست2، رسول زارع3
1کیلومتر6 جاده رشت -تهران، دانشگاه گیلان، دانشکده علوم کشاورزی، گروه گیاه پزشکی آزمایشگاه قارچ شناسی
2رشتلومتر 6 جاده تهران دانشگاه گیلان کی
3عضو هیات علمی / موسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور
چکیده مقاله:
گونه‌های کلادوسپوریوم به طور مکرر از مناطق مختلف ایران جداسازی شده‌اند. این مطالعه به منظور شناسایی مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه‌های آن انجام شده است. در این بررسی 17 جدایه از گونه مرکب C. cladosporioides، سه جدایه از گونه C. sphaerospermum و دو جدایه شبه-کلادوسپوریوم Chalastospora gossypii مورد بررسی قرار گرفت. DNA کل از میسلیوم و به روش Chelex استخراج و با جفت آغازگرهای ITS1، ITS5 و ITS4 تکثیر شد. توالی ناحیه rDNA ITS (شامل 5.8S) 29 جدایه به همراه شش توالی‌ به دست آمده از بانک ژن با دو روش تلفیق همسایه‌ها (Neighbor-Joining) و حداقل تکامل (Minimum-Evolution) با استفاده از نرم افزار MEGA 5.0 مورد تجزیه تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفت. نتایج اولیه نشان داد، در هر دو روش جدایه‌های مرتبط با گونه مرکب C. cladosporioides در یک کلاد و جدایه‌های گونه C. sphaerospermum در کلاد دیگر قرار گرفتند. بر اساس همین نتایج مشخص شد، ناحیه ژنی rDNA ITS قابلیت تفکیک گونه‌های نزدیک و یا نهفته در گونه مرکب C. cladosporioides را ندارد. این بررسی با توالی یابی ناحیه ژنی TEF ادامه دارد.
کلیدواژه ها:
تاکسونومی، تبار شناسی، توالی‌یابی، گونه مرکب
وضعیت : چکیده برای ارائه پذیرفته شده است