مطالعه مقدماتی فیلوژنتیکی برخی از جدایههای جنس Xylaria در شمال ایران |
کد مقاله : 2258-IPPC |
نویسندگان: |
سید عبدالله هاشمی *1، سید اکبر خداپرست2، رسول زارع3، سید علی الهی نیا4 1استان گیلان- رشت، کیلومتر 5 جاده رشت قزوین، دانشگاه گیلان، دانشکده علوم کشاورزی، گروه گیاه پزشکی 2رشتلومتر 6 جاده تهران دانشگاه گیلان کی 3عضو هیات علمی / موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور 4هیئت علمی گروه گیاه پزشکی دانشگاه گیلان |
چکیده مقاله: |
به منظور شناسایی مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی برخی جدایههای جنس Xylaria در شمال ایران، توالیهای ناحیه ITS rDNA (شامل 5.8S) 11 جدایه از گونه مرکب X. polymorpha، پنج جدایه X. cubensis و سه جدایه X. pannosa به همراه هشت توالی معتبر گرفته شده از بانک ژن مورد بررسی قرار گرفتند. DNA کل جدایهها از محتویات داخل پریتسیوم یا از آنامورف تشکیل شده در محیط کشت با استفاده از Chelex 5% استخراج و با یکی از جفت آغازگرهای ITS1F/ITS5/ITS1 و ITS4 تکثیر و توالییابی شد. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزارMEGA 5.0 انجام شد. از توالیهای Hypoxylon fragiforme و Camillea oburia به دست آمده از بانک ژن به عنوان گروههای خارجی استفاده شد. نتایج اولیه نشان داد که توالی ناحیه ITS میتواند گونه مرکب X. polymorpha را از سایر گونههای نزدیک به آن تشخیص دهد ولی به تنهایی جهت تفکیک اعضای این گونه مرکب از یکدیگر کافی نیست. جدایههای X. cubensis و X. pannosa نیز در یک گروه قرار گرفتند، بنابراین به نظر میرسد که ویژگیهای ریختشناسی ایکه تاکنون در کلیدهای شناسایی معمول جهت تفکیک این دو گونه استفاده میشدند کافی نیستند یا ممکن است این دو گونه مترادف هم باشند. |
کلیدواژه ها: |
تبارشناسی، ITS، Xylaria polymorpha، Xylaria cubensis، Xylaria pannosa، ایران |
وضعیت : چکیده برای ارائه پذیرفته شده است |